MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A plasmid pDOJH10S

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004253	AGC	2	6	23	28	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004253	ACGA	2	8	55	62	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004253	CGA	2	6	168	173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004253	CG	3	6	184	189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004253	TGC	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004253	GCC	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_004253	CG	3	6	303	308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004253	CGG	2	6	332	337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004253	TGA	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004253	GGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004253	GCC	2	6	495	500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_004253	GC	3	6	571	576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004253	CCA	2	6	600	605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_004253	TCA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_004253	CGAG	2	8	857	864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_004253	AAG	2	6	897	902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004253	CG	3	6	914	919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004253	CAT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004253	GCA	2	6	969	974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004253	GATTG	2	10	987	996	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004253	GGC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004253	GAT	3	9	1038	1046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004253	GCC	2	6	1134	1139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_004253	CCT	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_004253	GGCC	2	8	2786	2793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004253	CCG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_004253	ACG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004253	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_004253	GAT	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004253	GGA	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004253	ATC	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.